¿Agregar un recorrido en mi Pase es lo mismo que una reserva?

No, agregar un recorrido a tu Pase no equivale a una reserva. Si para tu recorrido se requieren reservas, deberás hacer una reserva de asiento y pagarla por separado. Para los trenes que requieren reserva, el inspector de boletos te pedirá ver tu reserva de asiento junto con tu boleto en la aplicación. 

Si no es necesario reservar asiento, puedes elegir cualquier asiento libre a bordo (excepto en 1a. clase si tienes un pase de 2a. clase). Agregar un recorrido en tu Pase no significa que tengas un asiento asignado.